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• 纪委办、监察处

• 党委宣传部

• 党委统战部

• 党委学生工作部（党委研究生工作部）

• 党委保卫部、人民武装部、保卫处

• 人力资源处

• 党委教师工作部

• 研究生院

• 本科生院(招生办公室)

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• 人文社会科学处

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• 审计处

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• 水利与土木工程学院

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• 人文与法学学院

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• 马克思主义学院

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• 国际教育学院

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• 国家农业制度与发展研究院

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• 管理训练中心

• 工程基础教学与训练中心

• 档案馆

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• 华南农业博物馆筹建办公室

• 中国农业历史遗产研究所

• 学报编辑部

• 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室

• 国家植物航天育种工程技术研究中心

• 农业部转基因植物及植物用微生物环境安全监督检验测试中心（广州...

• 广东农村政策研究中心

• 群体微生物研究中心

• 中国教育工会华南农业大学委员会

• 中国共产主义青年团华南农业大学委员会

• 华南农业大学校友会、广东省华南农业大学教育发展基金会

• 广东华农大资产经营有限公司

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